Характеристика микробоценоза ризосферы Вайды Красильной (Isatis Tinctoria)

Круговорот азота в природе - важнейшее звено в биогеохимических циклах нашей планеты.

Земная атмосфера, на 78 об. % состоящая из азота, служит, по сути дела, основным резервуаром этого важнейшего элемента всего живого. Азот входит в состав белков, нуклеиновых кислот, многих простых и сложных молекул, составляющих структуры организмов любого уровня от человека до микроорганизма. Человеку и животным азот нужен в виде белков животного и растительного происхождения, растениям - в виде солей азотной кислоты или ионов аммония.
Роль изучения почвенных микроорганизмов в последнее время начинает резко возрастать в связи с интенсификацией сельского хозяйства, а также с изменением и загрязнением биосферы, которое в настоящее время происходит из-за все усиливающейся хозяйственной деятельности человека. Необходимо знать законы по которым функционируют почвенные микроорганизмы в естественных экосистемах, определить происходящие в них изменения и наметить пути их регулирования (Методы почвенной микробиологии, 1987).

Увеличение продуктивности сельскохозяйственных культур, эффективное и ограниченное использование удобрений и средств защиты растений, а также повышение устойчивости и адаптации растений к неблагоприятным агроклиматическим условиям и антропогенным воздействиям являются актуальными для сельского хозяйства, а также для решения экологических проблем и охраны окружающей среды. Данные вопросы привлекают внимание многих ученых, работающих в различных областях науки: растениеводстве, почвоведении, агрономии, агрохимии, экологии, микробиологии и других. Особенно важными для решения этих задач являются микробиологические подходы и приемы, которые основаны на

использовании потенциала растений и почвенных микроорганизмов, и биологических механизмов взаимодействия компонентов растительно-микробных систем. Известно, что почвенные микроорганизмы активно взаимодействуют с растениями и могут оказывать как положительные, так и отрицательные эффекты на их рост и питание. В настоящее время накоплен большой материал о механизмах положительных воздействий ассоциативных ризосферных бактерий на растения. К таким механизмам относятся фиксация атмосферного азота, продуцирование биологически активных веществ, активизация потребления корнями питательных элементов, биоконтроль фитопатогенов и индуцирование системной устойчивости растений (Белимов, 2008).....

ВВЕДЕНИЕ5 Глава 1. Литературный обзор ................................................................................. 7 1.1 Понятие ризосферы ..........................................................................................7 1.2 Микроорганизмы ризосферы ..........................................................................9 1.3 Азотфиксирующие микроорганизмы ...........................................................12 1.3.1 Симбиотические азотфиксаторы ............................................................ 12 1.3.2 Свободноживущие азотфиксаторы......................................................... 14 1.3.3 Ассоциативные азотфиксаторы .............................................................. 16 1.3.4 Характеристика основных родов бактерий, способных к ассоциативной азотфиксации.................................................................. 17 1.3.5 Эндофитные азотфиксаторы ................................................................... 20 1.4 Биохимия азотфиксации и работа нитрогеназного комплекса ..................22 Глава 2 «Экспериментальная часть» ................................................................... 25 2.1 Объект и материалы исследования ...............................................................25 2.2 Методы исследования ....................................................................................27 2.2.1 Метод отбора ризосферной почвы.............................................................. 27 2.2.2 Метод приготовления почвенных суспензий ............................................ 27 2.2.3 Поверхностный метод посева на плотные среды. ..................................... 27 2.2.4 Метод глубинного посева ............................................................................ 28 2.2.5 Определение микробного числа почвы ...................................................... 28 2.2.6 Метод учета денитрифицирующих микроорганизмов. ............................ 28 2.2.7 Расчет количества денитрифицирующих микроорганизмов с помощью таблиц Мак Креди................................................................... 29 2.2.8 Выделение чистой культуры методом истощающего штриха................. 29 2.2.9 Метод учета азотфиксирующих и олигонитрофильных бактерий .......... 30 2.2.10 Микроскопические методы исследования ............................................... 30 2.2.11 Метод определения принадлежности по Граму ...................................... 30 2.2.12 Каталазная реакция .................................................................................... 31 2.2.13 Оксидазная реакция.................................................................................... 31 2.2.14 Определение продукции уреазы ............................................................... 32 2.2.15 Определение использования цитрата ....................................................... 32 2.2.16 ОФ-тест........................................................................................................ 33 2.2.17 Реакция Фогеса-Проскауэра ...................................................................... 33 2.2.18 Определение степени нитратредукции .................................................... 34 2.2.19 Разжижение желатина ................................................................................ 35 2.2.20 Ферментация углеводов ............................................................................. 35 2.2.21 Тест на лецитиназу ..................................................................................... 35 2.2.22 Постановка тест-систем API® stripsbioMérieux ...................................... 36 2.3 Список питательных сред ..............................................................................37 2.4 Результаты и их обсуждение .........................................................................40 ВЫВОДЫ .......................................................................................................................50 СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ ....................................................51 ПРИЛОЖЕНИЕ .............................................................................................................59

Дипломная работа «Характеристика микробоценоза ризосферы вайды красильной (isatis tinctoria)» включает 64 с., 13 рис., 1 табл., 1 приложение, 106 источников литературы.

Объектом исследования являлась ризосферная почва растения-сидерата вайды красильной. Материалами исследования послужили две пробы ризосферной почвы, полученные с корневой системы вайды красильной. Первая проба почвы была получена стряхиванием частиц почвы с корневой системы, вторая – соскабливанием почвы, непосредственно прилегающей к ризоплане.
Защита в 2013г, Южный Федеральный Университет, работа на отлично (5).

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ

1. Азубеков Л.X. Действие флавобактерина и удобрений на содержание NPK в растениях кукурузы в период вегетации// Бюлл. ВИУА №115, М., 2001. - С. 111-112.

2. Андреюк Е. И., Валагурова Е. В. Основы экологии почвенных микроорганизмов - К.: Наукова думка, 1992. - 223 с.

3. Байрамов Л.Э. Азотное питание и продуктивность ячменя при использовании биопрепаратов// Дисс. на соискание уч.степени к.б.н., М. 2001. - С.37-39.

4. Белимов А. А. и др. Характеристика и интродукция новых штаммов ассоциативных ростстимулирующих бактерий, доминирующих в ризоплане проростков ячменя //Микробиология. – 1999. – Т. 68. – С. 392-397.

5. Берцова Ю.В, Демин О.В., Богачев А.В. Дыхательная защита нитрогеназного комплекса у Azotobacter vinelandii // Успехи биологической химии, 2005. -Т. 45. - С. 205—234.

6. Биабани А. Особенности азотфиксации в псевдоклубеньках у растений пшеницы: автореф. дис. на соиск. учен. степ. канд. биол. наук: спец. 03.00.07 Моск. гос. ун-т им. М.В.Ломоносова. Фак. почвоведения. - М.: - 2004. - 22 с.

7. Борисов А.Ю, Наумкина Т.С., Штарк О.Ю. и др. Эффективность использования совместной инокуляции гороха посевного грибами арбускулярной микоризы и клубеньковыми бактериями// Доклады РАСХН. - 2004.- № 2.- С.. 12-14

8. Васильев Д.А., Золотухин С.Н., Никишина Н.М. Методы общей бактериологии. – Ульяновск, 1998. - 224 с.

9. ГОСТ 10444.1–84 Консервы. Приготовление растворов реактивов, красок, индикаторов и питательных сред, применяемых в микробиологическом анализе

10. ГОСТ 26670-91 Продукты пищевые. Методы культивирования микроорганизмов

11. ГОСТ 30425-97 Консервы. Метод определения промышленной стерильности

12. ГОСТ ISО 7218–2011 Микробиология пищевых продуктов и кормов для животных. Общие требования и рекомендации по микробиологическим исследованиям

13. ГОСТ Р 52426-2005 (ИСО 9308-1:2000) Вода питьевая. Обнаружение и количественный учет Escherichia coli и колиформных бактерий. Часть 1. Метод мембранной фильтрации

14. Готтшалк Г. Метаболизм бактерий. – М.: Мир, 1982. – 310 с.

15. Григорьева Т. В. Роль азотфиксирующих микроорганизмов в фиторемедиации промышленных углеводородных шламов, Ав-т на соискание... к.б.н., Казань – 2009. – 23 с.

16. Губанов И. А. и др. Иллюстрированный определитель растений средней России // Покрытосеменные (двудольные: раздельнолепестные).М.: Т-во научных изданий КМК, Ин-т технологических исследований. – 2003. – Т. 2. – 300 с.

17. Демченко М.М. Ризосферные микроорганизмы в системе почва-растение// Известия нижневолжского агроуниверситетского комплекса, - №4(12), 2008. – С.55-61

18. Дятлова К. Д. Микробные препараты в растениеводстве //Соросовский образовательный журнал. – 2001. – Т. 7. – №. 5. – С. 17-22.

19. Егоров Н.С. Руководство к практическим занятиям по микробиологии. М. : Изд-во МГУ, 1995.- 124 с.

20. Емцев В. Т. Ассоциативный симбиоз почвенных диазотрофных бактерий и овощных культур //Почвоведение. – 1994. – №. 4. – С. 74-78.

21. Емцев В.Т., Мишустин Е.Н. Микробиология. М.: Дрофа, 2005. - 445 с.

22. Ефимов В.Н., Волкова Е.Н., Елисеев А.С. Оценка влияния диазотрофов на азотное питание листовых овощных культур// Современные проблемы опытного дела. С.-Петербург. 2000,-том 2.-С. 153-158

23. Звягинцев Д. Г. (ред.). Методы почвенной микробиологии и биохимии. – Изд-во МГУ, 1991.. - 304 с.

24. Зенова Г.М., Степанов А.Л., Лихачева А.А., Манучарова Н.А. Практикум по биологии почв. М.: изд-во МГУ, 2002.-120 с.

25. Злотников А. К., Казакова М. Л., Злотников К. М. Новый бактериальный эндофит сельскохозяйственных культур //Сельскохозяйственная биология. Серия: Биология растений. Серия: Биология животных. – 2006. – № 3. – С. 62-66.

26. Игнатов В.В., Антонюк Л.П., Стадник Г.И. и др. Физиолого-биохимические аспекты ассоциативных отношений азоспириллы со злаками // 9-й Бахов. Коллоквиум по азотфиксации (Москва, 24 — 26 янв. 1996 г.): Тез. докл. Пущино, ОНТИ ПНЦ РАН, 1995. - С.6

27. Игнатов В.В., Биологическая фиксация азоты и азотфиксаторы // Соросовский образовательный журнал, 1998. - №9, – С. 28-33

28. Каменев C.B., Муромец Е.М. Генетический контроль процессов взаимодействия бактерий с растениями в ассоциациях.//Генетика. 1999 -Т.35 - № 11.-С.1480-1494

29. Кожевин П.А. Микробные популяции в природе. – М.: Изд-во Моск. Ун-та, 1989. – 175 с.

30. Кожемяков А.П. Основные механизмы взаимодействия растений с ассоциативными азотфиксирующими ризобактериями// Новое в с.х. производстве.-Луга.-КГУ.-1997.-С. 44-46

31. Кокорина А.Л., Кожемяков А.П., Тимофеева C.B. Эффективность влияния биопрепаратов комплексного действия на продуктивность овощных культур в различных регионах России// Известия Санкт — Петербургского ГАУ. Журнал №2. СПб. 2005.-С.41-46

32. Колешко О.И., Завезенова Т. В. Микробиология с основами вирусологии – Иркутск: Изд-во Иркут ун-та, 1999. – 452 с.

33. Коннова С.А. Полисахарид содержащие полимеры бактерий рода Azospirillum: разнообразие химического строения и функций. // Ав-т на соискание... д.б.н. М., -2003.

34. Кордюм В. А., Козыровская Н. А., Гуньковская Н. В. Теоретическое обоснование и экспериментальное создание азотфиксаторов нового типа, способных развиваться и фиксировать азот атмосферы в небобовых растениях //Биополимеры и клетка. – 1986. – Т. 2. – №. 5. – С. 227.

35. Кормильцева И. П. Изменение биологической активности чернозема выщелоченного при внесении 2,4,6-тринитротлуола, Ав-т на соискание... к.б.н., Казань – 2011. – С. 24.

36. Кукреш С.П., Ходянкова С.Ф. Эффективность применения азобактерина под лен- долгунец // Бюлл. ВИУА№115, М., 2001, с.38-39.

37. Лабутова Н.М., Поляков А.И., Лях В.А. и др. Влияние инокуляции растений клубеньковыми бактериями и эндомикоризным грибом Glomus Intraradices на урожай различных сортов сои и содержание белка и масла в семенах// Доклады РАСХН. №4.2004.-С. 10-12.

38. Львов Н. П. Молибден в ассимиляции азота у растений и микроорганизмов: Доложено на 43-м ежегодном Баховском чтении 17 марта 1987 г. – Наука, 1989. – Т. 43.

39. Менликиев М.Я., Султанова М.Х., Шарипова Н.У. Возможности биологической иммунизации хлопчатника эндофитными бактериями // Проблемы генетики, селекции и интенсивной технологии сельскохозяйственных культур. Душанбе, 1987. - С.76-77.

40. Менликиев М.Я., Султанова М.Х., Шарипова Н.У., Вьюницкая В.А. Биологическая иммунизация растений // 5-й Международный симпозиум по вертициллезному вилту, 25-30 июня 1990 г., Ленинград: Тез. докл. — Л.,1990.-С.101.

41. Методы почвенной микробиологии и биохимии / Под ред. Д.Г. Звягинцева. М.: Изд-во МГУ, 1991. 304 с.

42. Мишустин Е.Н., Емцев, В.Т. Микробиология. – М.: Агропромиздат, 1987. – 368 с.

43. Моргун В. В., Коць С. Я., Кириченко Е. В. Ростстимулирующие ризобактерии и их практическое применение //Физиология и биохимия культурных растений. – 2009. — Т. 41, № 3. — С. 187-207.

44. МУК 4.2.2413-08 "Лабораторная диагностика и обнаружение возбудителя сибирской язвы"

45. Оксенюк Н.Ф. Применение химических мер борьбы сорняками в насаждениях плодово-ягодных культур в Приморском крае // Селекция, сортоизучение, агротехника, защита плодово-ягодных культур и винограда. Владивосток, 1989. – С.24-29.

46. Определитель бактерий Берджи. Т. 1 / Под ред. Дж. Хоулта, Н. Крига, П. Снита, Дж. Стейли, С. С. Уилльямса. М.: Мир, 1997. – 432 с.

47. Определитель бактерий Берджи. Т. 2 / Под ред. Дж. Хоулта, Н. Крига, П. Снита, Дж. Стейли, С. С. Уилльямса. М.: Мир, 1997. – 368 с.

48. Патыка В.Ф., Калиниченко А.В., Колмаз Ю.Т., Кислухина М.В. Роль азотфиксирующих микроорганизмов в повышении продуктивности сельскохозяйственных растений// Микробиологический журнал, 1997, том 59, № 4, С. 3-14.

49. Пименова М. Н., Гречушкина Н. Н., Азова Л. Г. Руководство к практическим занятиям по микробиологии: Малый практикум: Учебное пособие. – МГУ, 1971. – 224 с.

50. Пимонов К. И. Возделывание вайды красильной в промежуточных посевах в звене кормового севооборота в условиях Ростовской области/ К. И. Пимонов, А. М. Струк // Известия высших учебных заведений. Сев.-Кав. регион. — 2003. — С. 149-161.

51. Понятаев В.Т. Грибы-эндофиты // Защита и карантин растений. -1999. - №9. - С. 31-32.

52. Саркисов Д.С., Перов Ю.Я. Микроскопическая техника: Руководство для врачей и лаборантов. — М.: Медицина, 1996. — 389 с.

53. Сахно О. Н., Трифонова Т. А. Экология микроорганизмов: учебное пособие: в 3 ч. Ч. 1. – 2007. – 234 с.

54. Скворцов И.М. Муцигель и слизь поверхности корней растений // Усп. Совр. Биол. 1994. Т. 114. С. 374-383.

55. Соколова М.Г., Акимова Г.П., Нечаева JI.B. Участие цитокининов в развитии бобово-ризобиального симбиоза при пониженной температуре// Агрохимия, 2005. - . №5. -С.66-70.

56. Сологуб Д.Б. Эффективность применения ризосферных диазотрофов под зерновые в зависимости от содержания органического вещества в почве// Автореф. дисс. канд. биол. наук. Москва.- 2005.- 20 с.

57. Столяров О. В. Влияние макро- и микроудобрений на симбиотическую активность и урожайность кормовых бобов //Вестник Российской академии сельскохозяйственных наук. – 2005. – №. 5. – С. 33-34.

58. Суховицкая, Л. А., Мохова, С. В., Сафронова, Г. В., Чернецова, И. Б., Мельникова, Н. В. Бактериальный препарат ризобактерин: штамм-продуцент, получение, итоги применения //Биотехнология. – 2001. – №. 2. – С. 57.

59. Теппер Е. З. Практикум по микробиологии: учебное пособие для студентов вузов по специальности 012400" Микробиология" и биологическим специальностям: допущено Министерством образования РФ //М.: Дрофа. – 2004. – 256 с.

60. Тихонович И. А. и др. Интеграция генетических систем растений и микроорганизмов при симбиозе //Успехи современной биологии. – 2005. – Т. 125. – №. 3. – С. 227-238.

61. Трепачев Е.П. Агрохимические аспекты биологического азота в современном земледелии. - М.: Агроконсалт.. 1999. - 532 с.

62. Умаров М.М. Ассоциативная азотфиксация. – МГУ, 1986. –136 с.

63. Фатина П. Н. Применение микробиологических препаратов в сельском хозяйстве //Вестник Астраханского государственного технического университета. - 2007. - № 4 (39). - С. 133-136

64. Фирсов Н.Н. Микробиология: словарь терминов. М: Дрофа, 2006. – 191 с.

65. Хабибуллина Ф.М Основы микробиологии и биотехнологии: сб. описаний лабораторных работ для подготовки дипломированного специалиста по направлению 656600 «Защита окружающей среды» спец. 280201 «Охрана окружающей среды и рациональное использование природных ресурсов» оч. и оч.-заоч. форм обуч; СЛИ. – Сыктывкар, 2007. – 36 с.

66. Хуснутдинова Р.М. Зависимость результатов микробиологического исследования от срока взятия биоматериала и выбора питательной среды [Электронное пособие для самостоятельной работы студентов]. – http://www.kbmk.kirov.ru/kmk/~library/7/doc/1/first.htm, - 2011г.

67. Цховребов В.С Изменения в составе живого вещества черноземов солонцеватых при сельскохозяйственном использовании // Вестник СГУ. – Ставрополь, 2004. - № 38. – С. 56-61.

68. Чеботарь В.К. Возможность использования ассоциативных азотфиксаторов для увеличения продуктивности растений сорго // Микроорганизмы стимуляторы и ингибиторы роста растений. Тез. докл. конф. - Ташкент. - 1989.- С. 40-41.

69. Чудинова Ю.В. Характеристика растительно-микробного сообщества ризосферы сорта льна Томской селекции Т-16 в льноводческих хозяйствах Томской области //Вестник Томского государственного университета. – 2007. – С. 249-251

70. Шилов А.Е. Бионеорганическая химия и катализ. Фиксация азота // Рос. хим. ж. (Ж. Рос. хим. об-ва им. Д.И. Менделеева). - 2004, т. XLVIII 4, - С. 6-11

71. Шлегель Г. Общая микробиология. – М.: Мир, 1987. –366 с.

72. Шпынев К.В. Streptococcus pyogenes: характеристика микроорганизма, выделение, идентификация и определение чувствительности к антибактериальным препаратам // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.- 2007. т.2, №.9. с.104-120.

73. Шурхно Р.А., Королёва Н.В., Наумова Р.П. Биологические свойства корнеобитаемой зоны многолетних бобовых трав// Доклады РАСХН. 2006. - №3. - C.33-36

74. Эффективность инокуляции семян биопрепаратами в чистых и смешанных посевах овса и люпина в зависимости от метеорологических условий //Аграрная наука — сельскому хозяйству: сборник статей: в 3 кн./IV Международная научно-практическая конференция (5-6 февраля 2009 г.). Барнаул: Изд-во АГАУ. 2009. - Кн. 2. 545 с. ISBN 978-5-94485-128-4. – С. 115.

75. Bartoli F. et al. A multiscale study of silty soil structure //European journal of soil science. – 2005. – Т. 56. – №. 2. – С. 207-224.

76. Boddey R.M., de Oliveira O.C., Urquiaga S., Reis V.M., de Olivares F.L., Baldani V.L.D. and Döbereiner J.Biological nitrogen fixation associated with sugar cane and rice: contributions and prospects for improvement //Plant and Soil. – 1995. – Т. 174. – №. 1-2. – С. 195-209.

77. Cacciari I., Lippi D. Arthrobacters: Successful arid soil bacteria: A review //Arid Land Research and Management. – 1987. – Т. 1. – №. 1. – С. 1-30.

78. Clark W. M., Lubs H. A. The differentiation of bacteria of the colonaerogenes family by the use of indicators //The Journal of Infectious Diseases. – 1915. – С. 160-173.

79. Doty S.L., Oakely B., Xin G., Kang J.W., Singleton G., Khan Z. et al Diazotrophic endophytes of native black cottonwood and willow //Symbiosis. – 2009. – Т. 47. – №. 1. – С. 23-33.

80. Downing K. J., Leslie G., Thomson J. A. Biocontrol of the Sugarcane Borer Eldana saccharina by Expression of the Bacillus thuringiensis cry1Ac7 andSerratia marcescens chiA Genes in Sugarcane-Associated Bacteria //Applied and environmental microbiology. – 2000. – Т. 66. – №. 7. – С. 2804-2810.

81. Gwinn K. D. et al. Resistance of endophyte-infected tall fescue seedlings to pathogens and pests //Tennessee farm and home science: progress report-Tennessee Agricultural Experiment Station. – 1991. – С. 72-77

82. Hallmann J. et al. Interactions between Meloidogyne incognita and endophytic bacteria in cotton and cucumber //Soil Biology and Biochemistry. – 1998. – Т. 30. – №. 7. – С. 925-937.

83. Hardoim P. R., van Overbeek L. S., Elsas J. D. Properties of bacterial endophytes and their proposed role in plant growth //Trends in microbiology. – 2008. – Т. 16. – №. 10. – С. 463-471.

84. Hinsinger P. et al. Rhizosphere geometry and heterogeneity arising from root‐mediated physical and chemical processes //New Phytologist. – 2005. –Т. 168. –№. 2. –С. 293-303.

85. Hoitink H. New approaches to plant disease and pest management: Alternatives to pesticides // http://www.plpa.agri.umn.edu/plpagrads/ abstracts.htm.

86. Hugh R., Leifson E. The taxonomic significance of fermentative versus oxidative metabolism of carbohydrates by various gram negative bacteria //Journal of bacteriology. – 1953. – Т. 66. – №. 1. – С. 24.

87. Koser S. A. Utilization of the salts of organic acids by the colon-aerogenes group //Journal of bacteriology. – 1923. – Т. 8. – №. 5. – С. 493-520.

88. Lin L. et al Theactinobacterium Microbacterium sp. 16SH accepts pBBR1-based pPROBE vectors, formsbiofilms, invades roots, and fixes N₂ associated with micropropagated sugarcaneplants// Appl Microbiol Biotechnol. –2011. T. 93(3), – С. 1185-1195

89. MacFaddin J. F. Enterobacteriaceae and other intestinal bacteria //Biochemical tests for identification of medical bacteria. Williams & Wilkins, Baltimore, Md. – 1980. – С. 439-464.

90. Maier R. M., Pepper I. L., Gerba C. P. (ed.). Environmental microbiology. – Academic press, 2009. – Т. 397. – 599 c.

91. Mano H., Morisaki H. Endophytic bacteria in the rice plant //Microbes and Environments. – 2008. – Т. 23. – №. 2. – С. 109-117.

92. Minamisawa K. et al. Anaerobic nitrogen-fixing consortia consisting of clostridia isolated from gramineous plants //Applied and environmental microbiology. – 2004. – Т. 70. – №. 5. – С. 3096-3102.

93. Naher U. A. et al. Growth enhancement and root colonization of rice seedlings by Rhizobium and Corynebacterium spp //Int J Agric Biol. – 2009. – Т. 11. – С. 586-590.

94. Postgate J. R. The fundamentals of nitrogen fixation. – CUP Archive, 1982. - 252

95. Preininger É. et al. In vitro establishment of nitrogen-fixing strawberry (Fragaria× ananassa) via artificial symbiosis with Azomonas insignis //In Vitro Cellular & Developmental Biology-Plant. – 1997. – Т. 33. – №. 3. – С. 190-194.

96. Rainey P. B. Adaptation of Pseudomonas fluorescens to the plant rhizosphere //Environmental Microbiology. – 1999. – Т. 1. – №. 3. – С. 243-257.

97. Ramos B. et al. Seasonal variations of Bacillus isolated from the rhizosphere of Elaeagnus angustifolia L //Orsis. – 1998. – Т. 13. – С. 7-16.

98. Raymond J. et al. The natural history of nitrogen fixation //Molecular Biology and Evolution. – 2004. – Т. 21. – №. 3. – С. 541-554.

99. Reinhold-Hurek B., Hurek T. Life in grasses: diazotrophic endophytes //Trends in microbiology. – 1998. – Т. 6. – №. 4. – С. 139-144.

100. Reinhold-Hurek B., Hurek T. Living inside plants: bacterial endophytes //Current opinion in plant biology. – 2011. – Т. 14. – №. 4. – С. 435-443.

101. Rosenblueth M., Martínez-Romero E. Bacterial endophytes and their interactions with hosts //Molecular Plant-Microbe Interactions. – 2006. – Т. 19. – №. 8. – С. 827-837.

102. Sevilla M. et al. Comparison of benefit to sugarcane plant growth and 15N2 incorporation following inoculation of sterile plants with Acetobacter diazotrophicus wild-type and nif mutant strains //Molecular Plant-Microbe Interactions. – 2001. – Т. 14. – №. 3. – С. 358-366.

103. Simmons J. S. A Culture Medium for Differentiating Organisms of Typhoid-Colon Aerogenes Groups and for Isolation of Certain Fungi With Colored Plate //Journal of Infectious Diseases. – 1926. – Т. 39. – №. 3. – С. 209-214.

104. Sun L. et al. Endophytic bacterial diversity in rice (Oryza sativa L.) roots estimated by 16S rDNA sequence analysis //Microbial ecology. – 2008. – Т. 55. – №. 3. – С. 415-424.

105. Tepfer D., Metzger L., Prost R. Use of roots transformed by Agrobacterium rhizogenes in rhizosphere research: applications in studies of cadmium assimilation from sewage sludges //Plant molecular biology. – 1989. – Т. 13. – №. 3. – С. 295-302.

106. Verma S. C., Ladha J. K., Tripathi A. K. Evaluation of plant growth promoting and colonization ability of endophytic diazotrophs from deep water rice //Journal of Biotechnology. – 2001. – Т. 91. – №. 2. – С. 127-141.

107. Wink J.M. Compendium of Actinobacteria [Electronic manual]. – http://www.dsmz.de/fileadmin/Bereiche/Microbiology/Dateien/Bacterial_Nomenclature_upto